Наше тело наполняют триллионы бактерий. Хорошей новостью является то, что эти миниатюрные обитатели довольно редко бывают вредными. Наоборот, они всеми силами поддерживают наш пищеварительный процесс, поднимают настроение, оберегают от болезней, а также повышают работоспособность. Однако понимание устройства этого партнерства длительное время ускользало от ученых.
Доктор медицинских наук, доцент кафедры медицины и генетики Стэнфордского высшего учебного заведения Ами Бхатт сообщил, что основной задачей группы исследователей было выявление способа взаимодействия клеток человека с микробиомом. Они предположили, что все дело в неизвестных миру миниатюрных белках.
И это вполне объяснимо, так как маленьким белкам было бы удобнее просачиваться через клеточную мембрану, передавая сигналы или угрозы соседним клеткам-хозяевам.
Читайте также: Надо ли лечить низкое давление
Дальше следовало определить и изучить этих неизведанных существ. Но, насколько каждый из нас знает, размер имеет значение, и найти предполагаемые мини-белки было довольно трудно.
Бактериальный геном похож на книгу с длинными буквенными комбинациями, только некоторые из которых кодируют сведения, важные для белкового производства. Уже по традиции ученые обнаруживают гены, кодирующие белки, с помощью поиска цепочек букв, которые указывают на сигналы «старт» и «стоп. Этот способ хорошо себя проявляет в отношении больших классических белков. Но чем они меньше, тем больше образуется ложных срабатываний.
Надеясь избавиться от проблемы, исследователи постарались провести оценку всего, что смогли отыскать. В одну базу внесли гены, которые, по их мнению, кодировали малые белки разных бактерий. Те, которые максимально часто встречались у нескольких видов и образцов, почти со 100%-ной вероятностью были истинно положительными.
Читайте также: Программа по уходу за пациентами со слабоумием показывает хорошие результаты
Когда этот метод применили к крупным наборам данных, то перед учеными предстали не сотни генов, как они изначально планировали, а сотни тысяч. Белки, теоретически кодируемые генами, могли быть отобраны в более чем 4000 связных комбинаций или семей, принимающих участие в основных биологических процессах, например, межклеточная связь или противостояние.
В последующем исследователи подтвердили, что найденные гены на самом деле кодируют истинные белки, продемонстрировав, что те транскрибируются в РНК, которая налаживает коммуникации с рибосомой для передачи данных - это основные этапы формирования белка в каждом организме.
Читайте также: Сердечные болезни: лечение диастолической дисфункции
На текущий момент ученые занимаются изучением всего вышеизложенного со смежными специалистами, чтобы больше узнать о способностях белков и найти функции максимально важные для бактерий, которые борются за место в нашем густонаселенном кишечнике.
Так как обнаруженные белки ничтожно малы - менее 50 аминокислот в длину - скорее всего, они объединяются в уникальные формы, которые представляют собой ранее неизвестные биологические блоки. Если формы и способности этих белков получится воссоздать в лабораторных условиях, произойдет настоящий прорыв в ученой среде, так как изменится понимание того, как микробиом влияет на здоровье человека.
Фото: saglikveguzellik.net
Читайте также: Четыре совета женщине, чтобы бросить курить